南京中医药大学会保护第一志愿的，这样会促进生源报考该大学。当然，不管是不是保护第一志愿，前提是你的分数需要够线，只有分数差不多的时候，第一志愿的优势才会提现出来。如果分数不够达标线，就没有和别人同台竞争的机会，不管什么情况，分数还是最重要的。