法律分析：
农村房屋产权纠纷的处理：首先可以由双方协商如何解决纠纷；协商不成可以到由县级以上地方土地管理部门申请解决，由县级以上地方土地管理部门责令停止侵犯、赔偿损失；如果还是没有解决纠纷可以提起民事诉讼解决。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第三百五十九条 住宅建设用地使用权期限届满的，自动续期。续期费用的缴纳或者减免，依照法律、行规的规定办理。
非住宅建设用地使用权期限届满后的续期，依照法律规定办理。该土地上的房屋以及其他不动产的归属，有约定的，按照约定;没有约定或者约定不明确的，依照法
律、行规的规定办理。